全市有耕地（水田、旱地、菜地）15.5万亩；园地（果园、茶园）2.9万亩；林地113.8 万亩。盛产龙岗“三黄鸡”、南头荔枝、南山桃、石岩沙梨、金龟桔、龙华方柿等农副产品。栖息、繁衍的国家级野生保护动物有虎纹蛙、蟒蛇、猕猴、大灵猫、金钱豹、穿山甲等。另外，经济价值较大的两栖动物有５种、爬行动物２３种、鸟类３０种、兽类３３种。

　　深圳西部和西南是珠江口、伶仃洋，东部和东南是大亚湾、大鹏湾，海岸线长达229.96公里，海岸资源极为丰富。  据考察，可建深水港的有６处（妈湾、赤湾、大梅沙、土围、西涌、大鹏湾）；可建中型港的有３处（蛇口、塘仁涌、盐田）；可建小型港的有１０多处。由于海域辽阔，自然资源极为丰富。有蛇遛、金色小沙丁、金钱鱼、大眼鲷、带鱼、二刺鲷、鲈鱼等３０－－４０种名贵鱼，还有虾、蟹、贝类和藻类。

　　深圳河发源于梧桐山牛尾岭，由东北向西南流入深圳湾，全长37km，河道平均比降1.1‰，水系分布呈扇形，主要支流有布吉河、福田河、皇岗河及香港一侧的梧桐河、平原河。流域面积312.5km2，其中深圳一侧187.5km2。

　　流域属南亚热带季风海洋性气候，雨量丰沛而集中。4～10月份为汛期，其中4～6月份为前汛期，后汛期为7～9月份。主要受灾害性台风及热带低压槽影响，常伴有暴雨和暴风潮，加之城市化面积逐渐增加，使其具有产流快、汇流时间短的特点。风暴潮也会使深圳湾潮位抬高，导致深圳河宣泄不畅，两岸发生洪涝灾害。